La Primera Temporada de Scrubs se estrenó el 2 de octubre de 2001 y tiene 24 episodios.

Episodio 1: Mi primer día
El doctor John Dorian, más conocido por sus amigos como J.D., se levanta de la cama en el primer día como médico interino en el Hospital del Sagrado Corazón. Sin embargo, J.D. es consciente de que después de todos estos años de estudio y entrenamiento está completamente verde para atender el servicio médico, es decir, para afrontar la cruda realidad del trabajo en un hospital. Su mejor amigo, Chris Turk, que también acaba de iniciar su periodo de prácticas, representa todo lo contrario: se siente seguro entre sus nuevos colegas del hospital. Desde el primer día en el hospital J.D. se siente atraído por una nueva compañera también novata: la atractiva doctora Elliot Reid.

Episodio 2: Mi mentor
Tras dos semanas en el hospital, J.D. comienza a ganar confianza como médico. Sin embargo, un joven nuevo paciente que, por culpa de su adicción al tabaco podría tener cáncer, le hace dudar. A J.D. le frustra mucho la actitud del paciente mientras intentan hacerle comprender la seriedad de su situación.

Episodio 3: El error de mi mejor amigo
J.D. tiene sólo 48 horas para tratar de besar a Elliot antes de entrar en la denominada zona de amigos. Turk, por su parte, comienza a estar mucho más tiempo con sus colegas cirujanos y su nueva novia, Carla, que con su amigo J.D..

Episodio 4: Mi vieja
A J.D., Elliot y Turk les asignan pacientes con distintas enfermedades. Los tres amigos, como médicos que son, saben perfectamente que, estadísticamente, uno de cada tres pacientes que ingresan en el hospital muere. Su experiencia con cada uno de sus pacientes les lleva a los tres a ver la vida desde una nueva perspectiva.

Episodio 5: Mis dos papás
Sin darse cuenta, J.D. revela al Dr. Kelso que el Dr. Cox está tratando de poner en práctica un procedimiento médico sin su autorización. El Dr. Cox se entera y se pone hecho una fiera porque únicamente estaba tratando de ayudar a un paciente cuyo seguro médico no cubre el coste de las pruebas que necesita. Dr. Kelso invita a J.D. a jugar al golf junto al Dr. Cox. Durante el recorrido cada uno de ellos le comenta a J.D. su particular opinión del mundo hospitalario.

Episodio 6: Mi malo
A J.D. le asignan la atención médica de Jordan Sullivan, una joven y atractiva mujer que, además de tener muy mal carácter, resulta que es un miembro importante del consejo de dirección de hospital. J.D. cree que lográndose su amistad ella podría hacer que le levantarán la suspensión del doctor Cox.

Episodio 7: Mi super ego
J.D. es el médico residente para los ojos del doctor Kelso hasta que un estudiante de medicina llamado Nick hace su aparición por el hospital. J.D. comienza a sentirse inferior en comparación a Nick, que siempre tiene una actitud positiva, conoce todas las respuestas a las preguntas de carácter médico que hace el doctor Kelso, se lleva de maravilla con las enfermeras y trata con impecable amabilidad a los pacientes.

Episodio 8: Mis quince minutos
Durante un descanso para comer algo, J.D. y Turk se pasan por un club que está siendo saboteado por un grupo de manifestantes. Un cámara de televisión que está cubriendo la noticia sufre un desmayo, por lo que J.D. y Turk se ven obligados a intervenir. Su actuación sale en televisión y todo el mundo, incluidos sus compañeros de hospital, les ve.

Episodio 9: Mi día libre
En la misma semana en que se celebra el Día de Acción de Gracias, J.D. es ingresado en su propio hospital con apendicitis. Elliot es el médico al que han asignado examinar el caso de J.D., mientras que Turk será el responsable de operar. J.D. está preocupado por quedar en manos de Turk, al que ve no como un cirujano responsable sino como al alocado e inmaduro compañero que fue en su instituto.

Episodio 10: Mi apodo
Tras algunos meses trabajando juntos en el hospital, J.D. y sus compañeros Turk, Carla y Elliot comienzan a afianzar su relación más allá del trabajo. J.D. y Carla incluso tratan de ser algo más que amigos. Pero la cosa no va a ser fácil.

Episodio 11: Mi Jesús personal
Las vacaciones de Navidad están provocando en el hospital del Sagrado Corazón sentimientos diversos. J.D. se siente un poco decaído por tener que pasar las fiestas trabajando en el hospital. Aprovechando la situación, el Doctor Cox le pide que le grabe en vídeo el nacimiento del hijo de uno de sus amigos.

Episodio 12: Mi cita a ciegas
La jornada en el hospital de J.D. se presenta especialmente agitada. Todos los médicos van como locos de un lado a otro atendiendo pacientes. El doctor Cox está incluso más gruñón que de costumbre porque está tratando de lograr un récord: que no se muere ningún paciente durante las 12 horas que dura su turno de trabajo.

Episodio 13: Mi malabarismo
J.D. está esperando a una de sus citas a ciegas en el hospital. La cita en cuestión no es otra que Alex, a la que J.D. no conoce físicamente y, por lo tanto, no sabe que es muy atractiva. Los dos se marchan a cenar a un restaurante y se quedan prendidos el uno del otro. La cosa sale tan bien que deciden volver a verse al día siguiente.

Episodio 14: Mi amigo drogata
Las relaciones entre pacientes, médicos y enfermeras están desembocando en algunas combinaciones extrañas. J.D. acaba teniendo un enfrentamiento con Alex, una de las empleadas sociales encargada de uno de sus pacientes drogadictos, el señor Barnes.

Episodio 15: Mis amigos de cama... y después
J.D. y Elliot deciden darle a su relación una dirección diferente, por lo que deciden pasar un día entero juntos en la cama. Tras el susto inicial, ambos se dan cuenta de que realmente son compatibles el uno con el otro. Sin embargo, un poco más tardes Elliot parece no querer anunciar a sus amistades su nueva relación, por lo que J.D. se cabrea.

Episodio 16: Mi intromisión heavy
Desde el abrupto fin del romance entre J.D. y Elliot, ninguno de los dos puede ver al otro, ni siquiera coincidir en una misma habitación. Su amistad ha cambiado para siempre. Para que la cosa se enrede todavía más, Turk comienza a preparar un estudio médico con Elliot, por lo que ésta se pasa todo el tiempo en el apartamento que Turk comparte con J.D.

Episodio 17: Mi estudiante
Tras finalizar su primer año como médicos residentes, J.D., Elliot y Turk suben un peldaño en el escalafón médico. Ahora son ellos los que esperan ansiosos la llegada de nuevos estudiantes de medicina para que les hagan las peores tareas.

Episodio 18: Mi corazón de Tuscaloosa
A J.D. le llega la hora de hacer frente a su mayor reto profesional cuando le asignan el tratamiento de un enfermo de cáncer de colon, el señor Simon. El problema es que el paciente es un poco cascarrabias y está constantemente amenazando a los médicos. J.D. trata de evitarlo y, al mismo tiempo, suministrarle los medicamentos que necesita. Todo parece ir bien hasta que el señor Simon muere. J.D. tiene entonces que dar explicaciones sobre el tratamiento que ha empleado con el fallecido.

Episodio 19: Mi viejo
Elliot y Turk está preocupados porque sus respectivos padres tienen previsto asistir a la conferencia que ambos darán en el hospital sobre enfermedades vasculares. J.D. les muestra toda su solidaridad y simpatía hasta que su propio padre aparece de sorpresa.

Episodio 20: Mi camino o la autopista
Elliot tiene que atender a un paciente, llamado Sean, del que nada más conocerle se siente atraída. Los dos tienes algunas cosas en común: están solteros, son un poco neuróticos y, además, padecen de estreñimiento. Elliot no hace más que enviarle señales dando a entender que se siente atraída por Sean, pero este parece no enterarse.

Episodio 21: Mi almeja exploratoria
A J.D. le pinchan de forma accidental con una aguja que ha sido usada para hacerle la prueba de hepatitis B a un paciente. J.D. reacciona muy tranquilo a pesar de que es consciente que podría haber contraído una enfermedad muy peligrosa. Durante el tiempo de espera para ver el resultado de la prueba cuatro médicos veteranos aterrorizan con sus peores diagnósticos al pobre J.D.

Episodio 22: Mi ocurrencia
El ex cuñado y amigo del doctor Cox, Ben Sullivan, tiene que pasarse por el hospital para que le curen una mano. Al final, es J.D. quien tiene que atenderle. Pero mientras están jugando una partida de billar en un bar cercano al hospital, J.D. y el resto de médicos se dan cuenta de que la mano de Ben parece temblar, lo que pone de manifiesto la posibilidad de que padezca alguna enfermedad grave.

Episodio 23: Mi héroe
Ben asume muy bien la noticia del diagnóstico de su leucemia. Sin embargo, es su hermana Jordan, la ex mujer del doctor Cox, quien parece tener más problemas en asumir la noticia. J.D. tampoco parece encajar muy bien el asunto.

Episodio 24: Mi último día
Es el mes de junio y los médicos residentes están a sólo un día de finalizar su periodo de prácticas. Todos están ansiosos, pero hay algo más en el ambiente: Carla y Turk discuten sobre salir con más gente, Elliot por fin se rebela contra todos aquellos que la tratan de forma desconsiderada y J.D., por su parte, trata de no cruzarse en el camino de nadie.

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