La Tercera Temporada de The Big Bang Theory se estrenó el 21 de septiembre de 2008 y tiene 23 episodios.

Episodio 1: La fluctuación del abrelatas eléctrico
Al descubrir que Leonard, Raj y Howard forzaron los resultados de la investigación realizada en el Ártico, un humillado y desilusionado Sheldon regresa a su casa en Texas.

Episodio 2: La conjetura de Pepito
Sheldon y Howard hacen una apuesta alocada. Y por otra parte la no tan perfecta noche de Leonard y Penny se acaba prontamente.

Episodio 3: La desviación Gothowitz
Howard lleva a Raj a que chequee el mundo gótico de las citas. Sheldon, por su lado, experimentará con chocolate en un intento por modificar la conducta de Penny.

Episodio 4: La solución de los piratas
Koothrappali les revela a los chicos que pronto será deportado. La razón es porque la universidad ya no financiará su investigación y él está en el país con visado de trabajo. Wolowitz, desmoronado con la noticia, intenta conseguirle a Koothrappali un nuevo empleo. Su entrevista al inicio va bien, hasta que él es presentado a su nuevo miembro del equipo, una bellísima científica.

Episodio 5: El dulce escalofriante revestimiento corolario
Koothrappali necesita la ayuda de Sheldon y le pide que sea su pareja en un torneo de cartas, dada la habilitad de este último para contar las cartas. Además, escuchó que Wil Wheaton participará en el torneo; lo que lo tiene muy excitado, pero no así a Sheldon.

Episodio 6: El vórtice Cornhusker
Leonard intenta desesperadamente llevarse bien con un viejo amigo de Penny, a quien le encanta el fútbol, así que acepta la ayuda de Sheldon cuando éste le ofrece compartir su sabiduría acerca del deporte rey. ¿Saldrá airoso de este compromiso?.

Episodio 7: La amplificación guitarrista
Un pequeño roce entre Leonard y Penny hará que Sheldon haga las veces de mediador, más por evitarse las molestias que esto le ocasiona, que por un acto desinteresado de altruismo.

Episodio 8: La deficiencia de pato adhesiva
Debido a que la mayoría del grupo se fue de viaje al campo, Sheldon tendrá que interpretar el papel de un héroe para salvar a una Penny herida

Episodio 9: La fórmula de la venganza
Barry Kripke le hace una broma de mal gusto a Sheldon en su espacio en NPR, lo que deja a nuestro neurótico favorito con ansias de venganza. Wolowitz, por su parte, no aguanta la presión de Bernadette para que este defina su relación de pareja, así que decide pedirle consejo a una Katee Sackhoff de fantasía.

Episodio 10: El experimento Gorila
Sheldon ayudará a Penny a entender mejor la profesión de Leonard, mientras que Wolowitz comienza a sentir celos cuando Leonard empieza a pasar más tiempo con la novia de Howard.

Episodio 11: La congruencia materna
Es Navidad y Leonard recibe la visita de su madre lo que alegra mucho a Sheldon. Sin embargo, Leonard siente que su madre lo deja de lado al no contarle lo que pasa en la familia y le preocupa que su madre no apruebe su relación con Penny.

Episodio 12: El vórtice psíquico
Leonard está aterrado al descubrir que Penny cree en las leyes de la física. Mientras, Sheldon ayuda a Raj a ligar en una fiesta universitaria.

Episodio 13: La reacción Bozeman
Cuando descubren que han robado en su apartamento, Leonard y Sheldon acuden a sus amigos para crear un nuevo sistema de seguridad.

Episodio 14: La aproximación de Einstein
Atascado en la solución de un problema de física, Sheldon busca hacer cosas que le ayuden a liberar su mente, como ir a trabajar con Penny.

Episodio 15: La gran colisión de Hadron
Leonard tendrá que elegir entre Penny o Sheldon para que le acompañen a Suiza a ver un acelerador nuclear de partículas el día de San Valentín.

Episodio 16: La gran adquisición
Cuando obligan a Sheldon a aparecer en los tribunales, su oportunidad de conocer al famoso dibujante de superhéroes Stan Lee entra en peligro.

Episodio 17: Una fragmentación muy valiosa
El descubrimiento de un anillo utilizado en la saga de El Señor de los Anillos pondrá en riesgo la amistad de los protagonistas.

Episodio 18: La alternativa a los pantalones
Sheldon necesita la ayuda de la pandilla cuando su pánico a hablar en público se interpone entre él y un codiciado premio que ha recibido.

Episodio 19: La recurrencia Wheaton
En la bolera, Sheldon termina implicado en un duelo contra el actor Wil Weathon.

Episodio 20: El catalizador de espagueti
eonard y Penny tienen una gran pelea que les lleva a dejar de hablarse. Sheldon hace todo lo que está en su mano para que ambos sean felices.

Episodio 21: La estimulación de la doctora Plimpton
eonard y Sheldon participan en una dura competición para ver quién se gana la atención de una famosa física, Elizabeth Plimpton.

Episodio 22: La implementación de la escalera continua

Episodio 23: La excitación lunar
Howard y Raj le buscan a Sheldon una cita por Internet. Penny teme que, después de haber estado con Leonard, no pueda salir con chicos normales.

Segunda Temporada
Primera Temporada