La Sexta Temporada de Anatomia de Grey se estrenó el 24 de septiembre de 2009 y tiene 24 episodios.

Resumen: Izzie vive y tras la muerte de George, cada uno intenta superarlo como puede. Meredith y Derek inician una etapa como matrimonio y Cristina verá peligrar su relación con Owen con la llegada de una antigua amiga de éste, Teddy Altman, que será la nueva cirujana cardiotorácica. Pero Cristina también parece atraer a un nuevo residente, el dr. Avery. Por otro lado, Bailey afronta una nueva etapa como mujer separada y madre de un hijo pequeño. Richard, el jefe, hace todo lo posible por llevar al Seattle Grace a ser el nº 1, por lo que lo fusionará con su "rival": el Mercy West, pero la presión sufrida le lleva a recaer en el alcohol. Tras esto, habrán muchos despidos, incluido el de Izzie, poniendo en jaque mate su matrimonio con Alex. Éste iniciará una relación de amor-odio con una de las nuevas compañeras, la dra. Reed, y volverá a tener una aventura con Lexie. Y mientras, Sloan y ella también tendrán un obstáculo en su relación: la llegada de la hija de él, una chica de 18 años que está embarazada y viene pidiéndole ayuda. Por último, la relación entre Derek y Richard cambiará, dado que para el neurocirujano, el jefe no está actuando bien. Después de que la junta decida suspenderlo en las funciones de jefe, Derek se convierte en el nuevo Jefe de Cirugía. Posterior tratamiento de rehabilitación alcohólica Derek decide contratar a Richard Webber como cirujano. Meredith y Derek están cada vez más cercanos y él decide pedirle un hijo. La hija de Sloan tiene su hijo y no sabe si quedárselo o entregarlo en adopción, después de sucesos y de que el mismo Sloan habló con ella, decide entregarlo en adopción y Teddy es contratada después de que casi es cambiada por un cirujano cardiovascular famoso

Episodio 1: Buen duelo
Izzie despierta y es recibida con una terrible noticia: La muerte de George. Meredith y los otros residentes lidian con la situación de diferentes modos.

Episodio 2: Adiós
A Cristina y Owen se les hace difícil seguir las órdenes de abstenecerce del sexo como se los pidió la Dr. Wyatt. Meredith y Derek consuman su amor en todas partes. Izzie sufre el impacto de la muerte de George y cada uno de los residentes asume la pérdida de un amigo que partió. El jefe da una noticia que impactará a todos.

Episodio 3: Siempore siento que me están observando
El paciente de Bailey y Alex complica su salud cuando llega su hijo esquizofrenico. Los residentes e internos de Seattle Grace compiten para sobrevivir al corto de empleados.

Episodio 4: Obligaciones contaminadas
Cuando el padre de Meredith y Lexie, Thatcher, regresa al hospital con un hígado fallido, es Meredith quien lo puede salvar. Izzie simpatiza con una paciente complicada con tumores y Mark, enojado con el comportamiento competitivo de Cristina, le tiende una trampa para asistir a una inusual cirugía.

Episodio 5: Invasión
Los residentes de Seattle Grace y Mercy West temen por sus cirugías y carreras cuando el día de la unión empieza. Arizona se enoja con Callie cuando su padre emplea a un cura para convencerla de salir con hombres, y Izzie lidia con la nueva competición.

Episodio 6: Yo vi lo que ví
Después que un paciente quemado muera inesperadamente en el medio de un caos en Emergencias, el jefe y el el miembro de la junta, Jennings, interrogan a los residentes para encontrar al culpable, todos los residentes de Mercy West y Seattle Grace defienden sus acciones en un esfuerzo por salvar sus carreras.

Episodio 7: Dale una oportunidad a la paz
Derek debe ayudar al más inusual de todos: el bioquímico del hospital, Issac, cuando descubre que tiene un tumor inoperable alrededor de su columna. Derek trata de engañar con dos cosas en una cuando cuestiona la autoridad del jefe.

Episodio 8: Invierte en el amor
Arizona se sorprende cuando los padres de un paciente dan al hospital una más que generosa donación, 25 millones de dólares, pero cuando la condición del paciente empeora, todo s los ojos están sobre Arizona para salvarlo. Cristina se cansa de Owen y empieza a probar sus límites con él, y Alex está perdido con la desaparición de Izzie, sin mencionar las deudas con el hospital olvidadas que debe pagar.

Episodio 9: Historia nueva
Cuando Owen recluta a su compañera veterana de Iraq, Teddy Altman, como la nueva cirujana cardiotorácica, Cristina cuestiona las habilidades de Teddy en el quirofano y la naturaleza de la relación entre Owen y ella. Mientras, Izzie regresa al Seattle Grace con su mentor de la secundaria buscando tratamiento para su demencia, y el stress de las responsabilidades de Richard, post-fusion, cobran su precio.

Episodio 10: Espíritu festivo
Al pasar el día de Acción de Gracias, Navidad y Año Nuevo, Miranda es visitada por su padre, William, que desaprueba sus elecciones de su vida; mientras, Mark y Lexie deben afrontar el arribo shockeante de una mujer del pasado de Mark, y Thatcher Grey cuestiona el reciente comportamiento del jefe a la vez que Meredith lo defiende.

Episodio 11: En un instante
Parte 1 del crossover entre Grey's Anatomy/Private Practice, Mark vuela a Oceanside para pedirle ayuda a Addison en el complicado embarazo de su hija; mientras, Owen cuestiona los motivos de Teddy al asignar a Cristina como jefe en una cirugía de alto perfil, y Derek tiene sospechas sobre la relación entre el Jefe y Bailey debido a que éste la ha pedido para asistirle en una cirugía complicada.

Episodio 12: Me gustas mucho más cuando te desnudas
Después de enterarse del problema con la bebida de Richard, Derek lo confronta por el bien de su amigo y del hospital, Izzie regresa, con la esperanza de reconciliarse con Alex, y las relaciones tensas suben de nivel entre Teddy, Cristina y Owen después de la confesión alarmante de Cristina.

Episodio 13: El estado del amor y la confianza
Derek comienza su labor de jefe interino, Él afronta una potencial demanda cuando Bailey y el paciente de Meredith despierta a mitad de la cirugía. Mientras tanto, Teddy rechaza seguir enseñando a Cristina, también Arizona prueba a Alex fuera de la pediatría, y Mark se niega hablar con la despechada Lexie, Derek trata de convencer a Richard de buscar tratamiento para su alcoholismo.

Episodio 14: La masacre de San Valentín
Los médicos atienden a decenas de personas después que el techo de un romántico restaurante se derrumbara el dia de San Valentín, Meredith lucha contra sus nuevos deberes como esposa del Jefe.

Episodio 15: La curvatura del tiempo
En su nuevo rol como jefe, Derek restaura la serie de conferencias en el hospital, y Richard, Bailey y Callie presentan los casos que marcaron su pasado, Bailey recuerda sus primeros días como una tímida residente, Callie recuerda un caso de polio, y Richard recuerda un caso en el cual él y Ellis trabajaron en un paciente diganosticado con GRID (Gay-related immune deficiency), una enfermedad después renombrada como SIDA. Los recuerdos resaltan el principio de relación entre Richard y Ellis en 1982. En secuencias que datan de 2004 el publico puede ver Bailey en sus días pre-Nazi, y A Callie poco tiempo antes de incorporarse al show.

Episodio 16: Un pequeñoa accidente perfecto
Cuando el famoso cirujano Dr. Harper Avery arriba al Hospital Grace de Seattle – Mercy West, el equipo se sorprende al descubrir que uno de ellos está muy relacionado con esta leyenda de la cirugía, también las exigencias nada ortodoxas de este cirujano causan tensión entre Derek y Richard, Mientras tanto Callie y Arizona intentan ayudar a Teddy y Sloan a olvidar el pasado y encontrar un arreglo en su amistad.

Episodio 17: Exigencia
Cristina actuara como una espia doble cuando Richard y Owen atiendan a una paciente con un tumor riesgoso del tamaño de un balón de futbol. Mientras tanto Mark decide invitar a salir a Teddy cuando lo llama a tratar a un paciente con un corazón desprendido. Callie plantea tener un futuro con hijos pero Arizona no esta igual de entusiasmada en ello.

Episodio 18: El suicidio es indoloro
Teddy trata a una paciente que desea morir, lo que hace que Owen recuerde su vida durante la guerra con Teddy. Meredith se pasa por alto sus labores de esposa del jefe para operar a un paciente y llega a descubrir que Derek a ganado la cirugía de ella. Richard sigue tratando de ganarse un lugar en el hospital pero es incapaz de comer con nadie porque todavía lo ven a él como el jefe. Los roses entre Arizona y Callie incrementan debido a si quieren o no tener hijos.

Episodio 19: Compasión por los padres
El hermano de Alex que no ha visto desde hace 7 años llega a visitarlo ya que tiene un tumor masivo. Cristina cometera un accidente al accionar una bala al corazón de una paciente alterando a Owen ya que no siguió sus ordenes. Lexie atiende un caso de rutina en una paciente llamada Alison, pero cuando su esposo vuelve ella no despierta, y a solicitado no mantenerla con vida. Al final aparece Sloan empezando su trabajo de parto.

Episodio 20: Tragándose el anzuelo
Sloan da a luz pero el que más sufrirá es Mark cuando su hija decide dar al bebé en adopción. Mientras tanto Tom Evans, llega por el puesto cardiotorácico ya que Teddy no esta aun contratada. Owen traiciona a Teddy a sus espaldas con Dereck, diciéndole que contrate a Evans. Dereck atiende a un hombre con un anzuelo grande culpando a su hijo del accidente. Callie intenta reconciliarse con Arizona. Al final Teddy queda contratada.

Episodio 21: Qué falta de tacto
Los doctores toman un curso de sensibilidad ya que atenderán a un paciente “grande” que se queja de dolor estomacal, pero los médicos no podrán evitar hacer chistes del hombre. Mientras tanto una paciente de accidente de motocicleta coquetea con Callie. Cristina se convierte en niñera de la hija de una paciente de Teddy. Callie y Arizona rompen. Dereck trata con una demanda por homicidio por negligencia, impuesta por Gary Clark el esposo de Alison.

Episodio 22: Radiantes de felicidad
Los médicos se ven envueltos en una historia romántica de dos pacientes que no se han visto desde hace mucho tiempo. Alex atiende a una paciente con antecedentes esquizofrénicos, pero el esta convencido que no esta loca y decide ayudarla. Meredith y Jackson atienden a una paciente que quiere una cirujia plástica tras sufrir un accidente de quemadura. Owen se confieza con Cristina pero Teddy escucha toda la conversación por accidente.

Episodio 23: Santuario (I)
Meredith descubre que está embarazada, pero las cosas se complican cuando el Sr. Clark entra perturbado al hospital buscando venganza por la muerte de su esposa (causada por el Dr. Derek Shephard), inicia disparándole a Reed y a Alex asi que la SWAT bloquea el hospital. Cristina y Owen rompen. Cuando Clark abre fuego en medio del hospital, Mark y Lexie atenderán la herida de bala de Alex fuera del quirófano. Bailey y su paciente intentan salvar a Percy, cuando este recibe un disparo. Al cierre del capitulo Derek y Clark discuten, pero cuando son interrumpidos por April, Clark le dispara a Derek.

Episodio 24: La Muerte y todos sus amigos
Meredith y Cristina luchan por salvar la vida de Derek. Lexie le dice a Alex que lo ama y él la confunde con Izzie. Cristina decide operar a Derek ella sola. Percy muere ya que Bailey no puede llegar a los quirófanos debido a que los ascensores no funcionan. En la operación de Derek, Clark regresa para detener a Cristina, pero Owen la salva y recibe un disparo y Meredith sufre un aborto involuntario, mientras intenta salvarle. Richard se desliza por el hospital y confronta a Clark, quien decide usar la última bala que le queda para suicidarse. Al final Derek se salva y Meredith llora la muerte de su hijo no-nacido.

Quinta Temporada
Cuarta Temporada
Tercera Temporada
Segunda Temporada
Primera Temporada 

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