La segunda temporada de El Mentalista se estrenó el  24 de septiembre de 2009 y tiene 23 episodios.

Episodio 1: Lo rojo de la redención
Se investiga el asesinato de una mujer que había sido acusada de robarle a su jefe un millón de dólares. Por su lado, Jane y Lisbon sienten impotencia al ver que el Agente Sam Bosco ahora será el encargado del caso de Red John.

Episodio 2: La letra escarlata
Lisbon y el equipo de CBI intentan resolver el asesinato de la asistente de un prominente Senador, mientras que Patrick no haya cómo sacarle algo de información al agente Bosco con respecto al caso de Red John.

Episodio 3: Placa roja
Lisbon se convierte en el principal sospechoso en el asesinato de un pedófilo, Razón por la cual asiste con más frecuencia a Psicoterapia. Jane, por su parte, le propone hipnotizarla para que recuerde lo sucedido la noche del crimen.

Episodio 4: Amenaza roja
Jane y el equipo del CBI investigan el asesinato de Gordon Hodge, un poderoso abogado, quien es responsable de permitir que un salvaje asesino, Van McBride, quede libre.

Episodio 5: Miedo rojo
El nuevo dueño de una antigua casa aparece muerto de la misma forma que el dueño original, y las sospechas caen sobre el supuesto fantasma que custodia su tesoro. El equipo se propone demostrar que todo es un engaño, y gracias a Jane comprenden el cómo se hace un montaje de espiritismo.

Episodio 6: Oro negro y sangre roja
Bosco arresta a Jane después de descubrir el micrófono con el cual le espiaba para enterarse del caso de Red John. Sin embargo, desde la cárcel aún logra ayudar en el caso de un hombre encontrado muerto por lo que parece una pelea entre familias por unos terrenos petrolíferos.

Episodio 7: Toros rojos
Minelli decide que el equipo de Lisbon y el de Bosco deben trabajar juntos en el caso del secuestro de una mujer. Sin embargo, la animosidad entre Bosco y Jane y el resto de los respectivos integrantes de cada equipo pone en riesgo el caso.

Episodio 8: Secretaría roja
Jane y Lisbon encuentran a Bosco herido gravemente de bala en su oficina y el resto de su equipo muerto. Finalmente se descubre que Rebecca es "discípula" de Red John y la que lamentablemente termina con la vida de Bosco, Hicks y otros dos agentes.

Episodio 9: Más valioso que un rubí
Patrick Jane y el resto del equipo son llamados para investigar robo y asesinato a un acaudalado joyero mientras asisten a una gala de beneficiencia en del CBI.

Episodio 10: Lanzando fuego
Mientras Jane y el equipo examinan la escena del crimen donde un estimado entrenador de béisbol fue asesinado, Jane es golpeado por una bola y comienza a tener flashbacks acerca de su adolescencia como falso síquico guiado por su inescrupuloso padre.

Episodio 11: De color de rosa
Rigsby acude como encubierto a una reunión de ex-alumnos de hace 15 años mientras el equipo investiga un doble asesinato aparentemente relacionado con una broma pesada. Jane le enseña a Rigsby a construir un palacio en la memoria.

Episodio 12: Corazón sangrante
Jane y el equipo investigan el asesinato del ayudante del alcalde mientras que Rigsby y Van Pelt hacen un gran anuncio.

Episodio 13: Línea roja
Jane investiga el asesinato de una atractiva vendedora de autos, encontrado muerto en la cajuela de un auto de un concesionario de lujo.

Episodio 14:: Sangre nuestra, sangre ajena
Cuando uno de los miembros de la pandilla a la cual Cho pertenecía, Avon Park Playboys, es asesinado, Jane insiste en ayudarlo en la investigación a pesar de que no les está permitido.

Episodio 15: Señuelo rojo
Jane y el equipo investigan el asesinato del famoso chef Gabriel Barge.

Episodio 16: Código rojo
La investigadora de armas biológicas, Julia Seberg,pide la ayuda de Jane y Lisbon cuando alguien le da una dosis letal de un peligroso virus áereo. Más tarde, las cosas se complican cuando ambos también se ven infectados.

Episodio 17: La caja roja
La muerte de un tutor se transforma en la búsqueda de un invaluable anillo robado desde el Museo Británico. Al mismo tiempo, Lisbon debe lidiar con su nueva jefa, Molly Hightower, cuando toma el control del equipo.

Episodio 18:  Agua roja
El equipo del CBI debe luchar para descubrir la identidad de una Jane Doe, la única testigo de un triple asesinato.

Episodio 19: Dinero de sangre
Jane deliberadamente se mete en problemas cuando busca al responsable de contratar a un sicario para asesinar a una fiscal.

Episodio 20: Rojo por los cuatro
Jane y el equipo de CBI visitarán el Centro de visualización creativa, una especie de culto religioso para adinerados, institución que se presume está relacionada con la muerte de un poderoso y adinerado dirigente mediático.

Episodio 21: 21-18-11-18
El equipo de CBI se encargará de averiguar la muerte de un genio matemático asesinado por un payaso.Jane muestra la importancia del procesamiento de la información por matrices, a través de la notación algebraica en el ajedrez.

Episodio 22: Carta roja
Cuando Jane y el equipo de CBI investigan la muerte de un influyente organizador de eventos de caridad, Patrick se encontrará con su antigua amiga la psíquica Kristina Frye.

Episodio 23: Cielo rojo al alba
Impactante capitulo que comienza con imitadores de Red John cometiendo un crimen. Kristina la psíquica amiga de Patrick Jane cometerá el mismo error que a Patrick le costo la vida de su esposa e hija.Será el primer enfrentamiento cara a cara de Patrick y Red John.

Primera Temporada

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